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El Estado de Tlaxcala, registra un acumulado de 14 denuncias penales presentadas por la Auditoria Superior de la Federación (ASF) ante la Procuraduría General de la República (PGR) por desvío de recursos públicos y diversas irregularidades localizadas en las cuentas públicas de los ejercicios fiscales 1998-2014.
De las 14 denuncias, una corresponde al municipio de Tlaxcala, la cual se presentó ante la PGR el 9 de febrero de 2012 correspondiente a la administración del exalcalde, Pedro Pérez Lira. Mientras que el resto de las querellas (13) fueron interpuestas contra el Gobierno del Estado.
Dos de las denuncias contra el Gobierno del Estado, fueron presentadas por simulación de reintegros, se trata de una práctica común entre los entes fiscalizables que consta en depositar a las arcas de la Hacienda Pública el recurso reclamado para cubrir las observaciones por malas prácticas fiscales, pero que después de unos días el depósito es retirado. Dichas denuncias fueron presentadas, una el 26 de agosto de 2014, y la otra el 30 de octubre de 2014.
El reporte de Denuncias Penales presentadas por la ASF de cuentas públicas 1998-2014, así como las relacionadas con simulación de registros, al corte de mayo de 2016, revela que Tlaxcala tiene procesos pendientes correspondientes a los ejercicios 2009, 2010, 2011 correspondientes a las auditorias 1220, 784, 780, y nueve acumuladas de la auditoria 589.
La ASF presentó nueve denuncias ante la PGR el día 24 de septiembre de 2015, las cuales corresponden a la cuenta pública 2009 correspondientes a la auditoria número 589 contra el Gobierno del Estado por malos manejos financieros.
El acumulado de denuncias con corte a mayo de 2016 es de un total de 700, de ellas 636 están en integración del Ministerio Pública; mientras que 25 ya fueron consignadas, en tanto que 12 están en no ejercicio de la acción penal; en tanto que nueve están en reserva; y 18 en amparo.