De acuerdo con una auditoria aplicada para el ejercicio 2017 la entidad fue la que mayor porcentaje de irregularidades tuvo con respecto al monto entregado por la federación
Sólo en la SESA hay daño patrimonial por 71 millones de pesos, mientras que en global sólo de 2011 a 2016 son mil 541 millones 400 mil pesos según la ASF